В настоящее время Центр является головной организацией по оказанию специализированной медицинской помощи населению, пострадавшему от катастрофы на ЧАЭС. Главной целью деятельности Центра является сохранение и улучшение здоровья людей, подвергшихся воздействию ионизирующего излучения вследствие Чернобыльской катастрофы.